Detalles de la búsqueda
1.
Neuron-specific chromatin disruption at CpG islands and aging-related regions in Kabuki syndrome mice.
Genome Res
; 2024 May 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38702196
2.
Removing unwanted variation between samples in Hi-C experiments.
Brief Bioinform
; 25(3)2024 Mar 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38711367
3.
Precision pharmacological reversal of strain-specific diet-induced metabolic syndrome in mice informed by epigenetic and transcriptional regulation.
PLoS Genet
; 19(10): e1010997, 2023 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37871105
4.
Quantification and statistical modeling of droplet-based single-nucleus RNA-sequencing data.
Biostatistics
; 2023 May 31.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37257175
5.
Promoter CpG Density Predicts Downstream Gene Loss-of-Function Intolerance.
Am J Hum Genet
; 107(3): 487-498, 2020 09 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32800095
6.
Simultaneous profiling of chromatin accessibility and methylation on human cell lines with nanopore sequencing.
Nat Methods
; 17(12): 1191-1199, 2020 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33230324
7.
Addressing the mean-correlation relationship in co-expression analysis.
PLoS Comput Biol
; 18(3): e1009954, 2022 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35353807
8.
A metabolomics approach identified toxins associated with uremic symptoms in advanced chronic kidney disease.
Kidney Int
; 101(2): 369-378, 2022 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34843755
9.
Coexpression patterns define epigenetic regulators associated with neurological dysfunction.
Genome Res
; 29(4): 532-542, 2019 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30858344
10.
Analyzing whole genome bisulfite sequencing data from highly divergent genotypes.
Nucleic Acids Res
; 47(19): e117, 2019 11 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31392989
11.
A ketogenic diet rescues hippocampal memory defects in a mouse model of Kabuki syndrome.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 114(1): 125-130, 2017 01 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27999180
12.
A screen of 1,049 schizophrenia and 30 Alzheimer's-associated variants for regulatory potential.
Am J Med Genet B Neuropsychiatr Genet
; 183(1): 61-73, 2020 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31503409
13.
Linear models enable powerful differential activity analysis in massively parallel reporter assays.
BMC Genomics
; 20(1): 209, 2019 Mar 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30866806
14.
Whole-genome analysis of the methylome and hydroxymethylome in normal and malignant lung and liver.
Genome Res
; 26(12): 1730-1741, 2016 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27737935
15.
Bacterial infection remodels the DNA methylation landscape of human dendritic cells.
Genome Res
; 25(12): 1801-11, 2015 Dec.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-26392366
16.
Coverage recommendations for methylation analysis by whole-genome bisulfite sequencing.
Nat Methods
; 12(3): 230-2, 1 p following 232, 2015 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25362363
17.
Orchestrating high-throughput genomic analysis with Bioconductor.
Nat Methods
; 12(2): 115-21, 2015 Feb.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-25633503
18.
Public data and open source tools for multi-assay genomic investigation of disease.
Brief Bioinform
; 17(4): 603-15, 2016 07.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-26463000
19.
Preprocessing, normalization and integration of the Illumina HumanMethylationEPIC array with minfi.
Bioinformatics
; 33(4): 558-560, 2017 02 15.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-28035024
20.
Joint Bounding of Peaks Across Samples Improves Differential Analysis in Mass Spectrometry-Based Metabolomics.
Anal Chem
; 89(6): 3517-3523, 2017 03 21.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-28221771